多药依赖的治疗是有挑战性的工作，相对于单种毒品滥用，多药依赖者的依赖程度和戒断症状表现个体差异更大、吸毒者有意识地掩饰吸食毒品等因素使多种毒品滥用治疗面临更复杂。
多药依赖治疗相关的几点特殊性需要特别关注：一是理清主要毒品品种和次要毒品品种;二是判断是否已形成多重毒品依赖;三是鉴别多药依赖的动机。例如：接受美沙酮维持治疗的海洛因为主要毒品品种的多药依赖者比治疗前显著地降低了可卡因和苯二氮卓类的用量。四分之一美沙酮维持治疗在随后的两年随访期内能够保持至少三个月不滥用其它毒品的操守期;使用可卡因作为辅助毒品的海洛因依赖者从接受治疗时的28.1%减低为两年后的11.9%;共同滥用海洛因和可卡因的人从26.9%降低为8.4%。
这些研究结果表明针对主要毒品品种的治疗对于多药依赖有较好的影响。对于已经形成多重毒品依赖治疗，鲜有这方面的文献报道。原因在于一些专设的治疗机构只关注主要毒品品种引起的问题，而不关心其它毒品引起的问题;再者，缺少针对多重毒品依赖的治疗药物或治疗方案，特别是同时应用精神兴奋剂和阿片类药物依赖的治疗药物或治疗方案。多药依赖者常因试图改善睡眠、缓解疼痛、增强欣快感、替代原滥用药物、用于自行戒毒等目的而共滥用其它精神活性物质，所以必须有针对性地对不同用药动机采取必要的心理干预措施。使用非法精神活性物和合法精神活性物质之间是存在着一定的关联的。
吸食传统毒品的人群中吸食大麻的人比例比较高。有证据表明，通过影响定价、课税、规范销售和消费场所、消费时间等，会对多药依赖产生深远的积极影响。
综上所述，在毒品滥用流行的国家和地区，多药依赖现象十分普遍，已经成为当今多药依赖的常态模式，多药依赖所带来的医学问题和社会问题与日俱增。尽管已有的成果表明，针对于主要毒品品种的治疗可以减少多药依赖，但目前如何应对多药依赖仍是一个挑战。在概念上，多药依赖人群和滥用模式的划分很不统一；在实践上，缺少有效的诊断、治疗、康复和预防措施。