摇头丸具有兴奋和致幻双重功效，服用它的危害极大，毒品对中枢神经系统和周围神经系统都有很大的损害，可产生异常的兴奋、抑制等作用，出现一系列神经、精神症状，如失眠、烦躁、惊厥、麻痹、记忆力下降、主动性降低、性格孤僻、意志消沉、周围神经炎等。

摇头丸是苯丙胺类兴奋剂的衍生物，它可以刺激周围神经系统的儿茶酚胺递质释放，从而对心血管产生兴奋性作用。但是大量的儿茶酚胺递质可以导致心肌细胞肥大、萎缩、变性、收缩带坏死、小血管内皮细胞损伤和小血管痉挛，从而使吸食者出现急性心肌缺血、心肌病和心律失常等心血管疾病，这同时也是摇头丸吸食者突然死亡的原因。

摇头丸主要可导致缺血性心肌病，使吸食者出现头痛、寒战、心悸、心律不齐、心绞痛、等症状;还可引起胃功能障碍，出现如口干、口中有金属味道、厌食、恶心、呕吐、腹泻、腹部绞痛等诸多症状。

此外，如一次性服用较大量的摇头丸，可以导致吸食者全身骨骼肌痉挛、肌溶解，出现恶性高热、死亡或对肾功能造成严重损害，这也是摇头最常见的危害之一。同时，服用摇头丸还会发生其他滥用感染合并症，包括肝炎、细菌性心内膜炎、败血症和性病、艾滋病。